一家成功的连锁经营总部必须经过相当长时间的努力，才能树立起自己独特的形象，并为广大消费者所接受，这中间也必然需要投入大量的人力物力。这种付出理应得到实现目标，因此加盟者获得使用连锁总部的商标权利并得到其全力支援，这一切并非是免费的，他必须向总部交纳一定的特许经营费用。实践中连锁经营总部收取费用的方式也不尽相同：有些总部一次结清，有的总部则逐项逐次列明费用；有些是一次性买断特许经营权，以后各不相干；但大多数是把收费限定定得较长，保留双方长时间的联系。由于方式多样，这就要求加盟者在签订合同之时，应逐项细心研究，认清楚各种方法的利弊，很好征询有关专业人士，以免将来被动。
    不同连锁总部的收费的方式会有所不同，常见的有以下几种：

    (1)加盟费
    这是加盟者为取得连锁经营权，在签订合约时向总部一次交纳的一笔费用，但合约期满或中途退出时不退还。这笔费用一般占加盟者全部智慧之选的5%～10%。
 
    (2)提高/增加金
　　这是连锁总部进行经营指导而收取的费用，加盟店按月交纳，其计算方法依行业不同而不同。

    (3)其他费用
    如市场调查费、培训费、专利设备费、广告宣传费、促销公关费等。
    智慧之选者在分析加盟总部收取的费用并确认合理后，接下来便是对加盟后的营业额及收银做一个初步的估计，以得知智慧之选经营的高低。一般情况下，加盟总部会给智慧之选者一个参考的营业额或收银数字，但他们为了吸引智慧之选者，往往会将营业额或收银计算得较为乐观，智慧之选者应注意分析其计算方法是否正确，必要时，加盟者应当征求专业人士的意见。智慧之选者拿到总部的营业额或收银数字后，还要考虑几个方面的问题，一是季节波动性，二是经济波动因素，三是其他开支。
    智慧之选者很好将经济情况分成很好的情况、一般的情况、不太理想的情况三种可能，来预测营业额和收银，以便得知在坏的情况下自己是否能承受。然后再根据准确的营业额和收银估计，推算出自己的智慧之选回收期。一般可经营的行业，回收期在半年至两年间，收银一般的为2～3年时间，而智慧之选大、收银低的行业，则要3—4年时间。超过4年的，智慧之选者就要认真考虑是否值得智慧之选了。